植物查爾酮異構酶的生物信息學分析

采用生物信息學方法和工具對GenBank中的洋蔥、豌豆、番茄和茶等植物的黃酮類化合物合成關鍵酶查爾酮異構酶(CHI)的核酸和氨基酸序列進行了比對、分析和建模,進而對其分子結構、理化性質、亞細胞定位、蛋白轉運肽、跨膜結構域、疏水性、分子系統(tǒng)進化、蛋白質二級和三級結構等重要參數(shù)進行了預測和推理.結果表明:該類酶基因的全長包括5'、3'非翻譯區(qū)和一個開放閱讀框,無蛋白轉運肽,且定位于細胞質基質,是一個疏水性蛋白,二級結構均以隨機卷曲和α-螺旋為主要構件,洋蔥和豌豆的CHI三維建模成功.

作 者： 雷桅 鄒祥 向陽 湯紹虎 孫敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min   作者單位： 雷桅,向陽,湯紹虎,孫敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大學,生命科學學院,三峽庫區(qū)生態(tài)環(huán)境教育部重點實驗室,重慶,400715)

鄒祥,ZOU Xiang(西南大學藥學院,重慶,400715) 

刊 名： 北方園藝  PKU 英文刊名： NORTHERN HORTICULTURE  年，卷(期)： 2008 ""(2)  分類號： Q946.5 Q558  關鍵詞： 查爾酮異構酶   生物信息學   黃酮類化合物  

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